Ulkoisesti heijastuu sisäinen sairauden olemus. Sen olemus on siinä, että homeopaattisten keinojen valinta perustuu oireiden mahdollisimman suureen samankaltaisuuteen. Toisin sanoen mehiläisen myrkky aiheuttaa turvotusta, punoitusta ja kuumetta. Samanlaiset oireet, riippumatta niiden aiheuttajasta, voidaan parantaa aineella, joka on valmistettu mehiläisen myrkystä.
"Lääketieteen organon": "Jotta voit hoitaa oikein, turvallisesti, nopeasti ja luotettavasti, valitse jokaisessa yksittäisessä tapauksessa vain sellainen lääke, joka voi aiheuttaa tilan, joka on samanlainen kuin kärsimys, jota on määrä parantaa".
Samuel Hahnemann selitti lääkkeiden vaikutuksen samankaltaisuusperiaatteen mukaisesti siten, että homeopaattinen aine, joka joutuu potilaan elimistöön, aiheuttaa "lääketieteellisen sairauden", joka syrjäyttää "luonnollisen sairauden" elimistöstä. Tämä tapahtuu, jos "lääketieteellinen sairaus" on tarpeeksi voimakas. Mitä samankaltaisemmat "lääketieteellisen sairauden" oireet näyttävät luonnollisten oireiden kanssa, sitä voimakkaampi on lääkkeen vaikutus.
Homeopaattinen lääke määrätään samankaltaisuusperiaatteen mukaisesti tarkan anamneesin keräämisen jälkeen. Määrätään yksinomaan yksi lääke tiettyyn annokseen ja potenssiin, jonka jälkeen seurataan potilaan tilaa.